Am Dienstort Nördlingen ist das Finanzamt in zwei Gebäuden untergebracht:

Das Gebäude am Tändelmarkt 1 wurde seit der Fertigstellung im Jahr 1991 zunächst teilweise, seit der Verlagerung des Vermessungsamts im Jahre 2005 vollständig vom Finanzamt genutzt. Das Gebäude wurde vom Architekten Freiherr von Branka entworfen und geplant.

Das angemietete Gebäude Bauhofgasse 9 wird seit dem Jahr 2018 vom Finanzamt genutzt. Die Anmietung wurde erforderlich, um die Beschäftigten unterbringen zu können, die für die Besteuerung der polnischen Bauunternehmer zuständig sind.

Am Dienstort Donauwörth ist das Finanzamt im wesentlichen im 1969 fertiggestellten Bau Sallingerstraße 2 untergebracht. Seit 2020 wird zusätzlich das 2. Obergeschoss des Amt für Breitband, Digitalisierung und Vermessung genutzt: Hier ist die Betriebsprüfungsstelle untergebracht. Der Anbau am Gebäude Sallingerstraße 2 wird seit Anfang 2021 durch eine Bearbeitungsstelle des Finanzamts München genutzt.